Mars. Få dage før Allehelgensaften 2071. Nogle skurke sprænger en tankbil i luften på Highway 1 og slipper en dødelig virus fri, som dræber hundredvis af mennesker. Fordi myndighederne frygter et endnu mere ødelæggende biokemisk angreb, udloves der en astronomisk dusør for pågribelse og anholdelse af den person, som står bag attentatet. På rumskibet "Bebop" keder Spike og hans besætning af dusørjægere sig og mangler penge. Men nyheden om dusøren ændre alt.